Pymol
- PyMOL is a molecular graphics system with an embedded Python interpreter designed for real-time visualization and rapid generation of high-quality molecular graphics images and animations. It can also perform many other valuable tasks (such as editing PDB files) to assist you in your research.
- Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki oleh suatu molekul.
Berikut cara mudahnya :
- Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.
- Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue → Alanine.
- kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur L-toolbar → other properties →formal charge
- jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar → vdw radius
- untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar → element symbol
- Lalu pilih S-toolbar → dots
- Dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar→ mesh dan S-toolbar → surface
- Selanjutnya view dan kemudian Orient
Mudah bukannnn??? Selamat Mencoba ...
0 komentar:
Posting Komentar